妈咪保贝新生版包含了5种少儿罕见疾病，即肺淋巴管肌瘤病、肺泡蛋白质沉积症、婴儿进行性脊肌萎缩症、肝豆状核变性（Wilson病）、严重多发性硬化。
这5种少儿罕见疾病都是在《第一批罕见病》目录中，这也就意味着，这5种罕见疾病是临床需求较为迫切、疾病负担比较重、社会关注度较高的疾病。
妈咪保贝新生版针对少儿罕见疾病的赔付比例也是十分优秀的，可以额外赔付200%基本保额，也就是说罹患少儿罕见疾病的话，可以获得3倍保额的赔付。